Gene: Cre04.g217951 (Genome version: v5.5)

Overview

Common name:LCI33
Defline:Low-CO2-inducible protein
Description:Low-CO2 inducible gene (homologous to unknown protein in Trypanosoma brucei) revealed by cDNA array analyses
Synonyms:g4581.t1,Cre03.g209350.t1.1,Cre03.g209350.t1.2,LCI33
Chromosome:chromosome_4

Protein Localization

We did not create a plasmid for this gene.

Protein-Protein Interactions

We did not determine any protein-protein interactions for this gene.

Mutant Strains

Insertion Junction Mutant Strain Orientation Insertion Junction Feature Confidence (%)
LMJ.RY0402.039349_2 LMJ.RY0402.039349 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.042450_1 LMJ.RY0402.042450 sense CDS 95
LMJ.RY0402.042450_2 LMJ.RY0402.042450 sense CDS 95
LMJ.RY0402.043117_1 LMJ.RY0402.043117 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.044616_1 LMJ.RY0402.044616 sense CDS 95
LMJ.RY0402.044616_2 LMJ.RY0402.044616 sense CDS 95
LMJ.RY0402.045892_1 LMJ.RY0402.045892 antisense intron 73
LMJ.RY0402.049467_1 LMJ.RY0402.049467 sense intron 73
LMJ.RY0402.052647_2 LMJ.RY0402.052647 antisense intron 95
LMJ.RY0402.052682_1 LMJ.RY0402.052682 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.053024_3 LMJ.RY0402.053024 antisense CDS 58
LMJ.RY0402.053219_1 LMJ.RY0402.053219 sense intron 95
LMJ.RY0402.053219_2 LMJ.RY0402.053219 sense intron 95
LMJ.RY0402.054433_1 LMJ.RY0402.054433 sense CDS 73
LMJ.RY0402.054869_1 LMJ.RY0402.054869 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.054869_2 LMJ.RY0402.054869 antisense intron 95
LMJ.RY0402.055208_1 LMJ.RY0402.055208 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.055208_2 LMJ.RY0402.055208 antisense intron 95
LMJ.RY0402.060353_1 LMJ.RY0402.060353 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.067190_1 LMJ.RY0402.067190 sense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.070012_1 LMJ.RY0402.070012 sense intron 73
LMJ.RY0402.076028_1 LMJ.RY0402.076028 antisense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.077989_1 LMJ.RY0402.077989 sense CDS 58
LMJ.RY0402.078825_1 LMJ.RY0402.078825 antisense 3'UTR 58
LMJ.RY0402.078935_1 LMJ.RY0402.078935 antisense intron 73
LMJ.RY0402.081335_1 LMJ.RY0402.081335 antisense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.081335_2 LMJ.RY0402.081335 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.083214_1 LMJ.RY0402.083214 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.083644_1 LMJ.RY0402.083644 sense CDS 73
LMJ.RY0402.085644_2 LMJ.RY0402.085644 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.086979_2 LMJ.RY0402.086979 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.097247_1 LMJ.RY0402.097247 sense CDS 73
LMJ.RY0402.097910_1 LMJ.RY0402.097910 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.101381_1 LMJ.RY0402.101381 sense intron 95
LMJ.RY0402.101381_2 LMJ.RY0402.101381 sense intron 95
LMJ.RY0402.106935_1 LMJ.RY0402.106935 antisense intron 73
LMJ.RY0402.108364_3 LMJ.RY0402.108364 antisense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.108364_4 LMJ.RY0402.108364 antisense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.109852_3 LMJ.RY0402.109852 sense CDS 73
LMJ.RY0402.112369_2 LMJ.RY0402.112369 sense intron 73
LMJ.RY0402.115590_2 LMJ.RY0402.115590 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.117186_1 LMJ.RY0402.117186 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.117186_2 LMJ.RY0402.117186 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.117382_2 LMJ.RY0402.117382 sense intron 73
LMJ.RY0402.119290_1 LMJ.RY0402.119290 antisense intron 95
LMJ.RY0402.119290_2 LMJ.RY0402.119290 antisense intron 95
LMJ.RY0402.120088_1 LMJ.RY0402.120088 sense 3'UTR 95
LMJ.RY0402.120088_2 LMJ.RY0402.120088 sense 3'UTR 95
LMJ.RY0402.120324_1 LMJ.RY0402.120324 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.120324_2 LMJ.RY0402.120324 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.123214_1 LMJ.RY0402.123214 sense intron 58
LMJ.RY0402.124811_1 LMJ.RY0402.124811 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.125566_2 LMJ.RY0402.125566 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.125651_1 LMJ.RY0402.125651 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.129041_1 LMJ.RY0402.129041 antisense intron 58
LMJ.RY0402.129355_1 LMJ.RY0402.129355 antisense intron 95
LMJ.RY0402.129355_2 LMJ.RY0402.129355 antisense intron 95
LMJ.RY0402.131475_2 LMJ.RY0402.131475 antisense intron 73
LMJ.RY0402.132321_1 LMJ.RY0402.132321 antisense intron 73
LMJ.RY0402.132848_2 LMJ.RY0402.132848 sense intron 73
LMJ.RY0402.133294_1 LMJ.RY0402.133294 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.133294_2 LMJ.RY0402.133294 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.133952_2 LMJ.RY0402.133952 sense CDS 73
LMJ.RY0402.135449_1 LMJ.RY0402.135449 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.137941_1 LMJ.RY0402.137941 antisense intron 95
LMJ.RY0402.137941_2 LMJ.RY0402.137941 antisense intron 95
LMJ.RY0402.138239_1 LMJ.RY0402.138239 sense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.138582_1 LMJ.RY0402.138582 sense intron 73
LMJ.RY0402.139065_1 LMJ.RY0402.139065 antisense intron 73
LMJ.RY0402.139285_1 LMJ.RY0402.139285 sense intron 95
LMJ.RY0402.140368_2 LMJ.RY0402.140368 antisense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.140615_1 LMJ.RY0402.140615 antisense intron 73
LMJ.RY0402.143988_1 LMJ.RY0402.143988 antisense CDS 58
LMJ.RY0402.144017_2 LMJ.RY0402.144017 sense CDS 73
LMJ.RY0402.146505_1 LMJ.RY0402.146505 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.148193_1 LMJ.RY0402.148193 antisense intron 73
LMJ.RY0402.148467_1 LMJ.RY0402.148467 antisense intron 73
LMJ.RY0402.152789_1 LMJ.RY0402.152789 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.158330_1 LMJ.RY0402.158330 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.158555_1 LMJ.RY0402.158555 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.158555_2 LMJ.RY0402.158555 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.158922_1 LMJ.RY0402.158922 sense CDS 73
LMJ.RY0402.163551_1 LMJ.RY0402.163551 sense CDS 58
LMJ.RY0402.165016_1 LMJ.RY0402.165016 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.166859_1 LMJ.RY0402.166859 sense intron 73
LMJ.RY0402.167003_1 LMJ.RY0402.167003 antisense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.167003_2 LMJ.RY0402.167003 antisense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.167334_1 LMJ.RY0402.167334 antisense intron 73
LMJ.RY0402.168737_1 LMJ.RY0402.168737 sense intron 73
LMJ.RY0402.168838_2 LMJ.RY0402.168838 sense CDS 95
LMJ.RY0402.168838_3 LMJ.RY0402.168838 sense CDS 95
LMJ.RY0402.169051_3 LMJ.RY0402.169051 antisense CDS 58
LMJ.RY0402.170868_1 LMJ.RY0402.170868 sense CDS 73
LMJ.RY0402.172420_1 LMJ.RY0402.172420 antisense intron 73
LMJ.RY0402.173371_2 LMJ.RY0402.173371 sense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.173674_1 LMJ.RY0402.173674 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.174351_2 LMJ.RY0402.174351 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.176370_1 LMJ.RY0402.176370 sense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.176370_2 LMJ.RY0402.176370 sense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.177792_3 LMJ.RY0402.177792 antisense intron 58
LMJ.RY0402.181919_1 LMJ.RY0402.181919 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.182587_1 LMJ.RY0402.182587 antisense intron 95
LMJ.RY0402.182587_2 LMJ.RY0402.182587 antisense intron 95
LMJ.RY0402.185137_2 LMJ.RY0402.185137 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.185223_1 LMJ.RY0402.185223 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.185852_1 LMJ.RY0402.185852 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.187339_1 LMJ.RY0402.187339 sense CDS 95
LMJ.RY0402.187339_2 LMJ.RY0402.187339 sense CDS 95
LMJ.RY0402.187423_2 LMJ.RY0402.187423 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.192916_1 LMJ.RY0402.192916 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.195793_1 LMJ.RY0402.195793 antisense 3'UTR 95
LMJ.RY0402.195793_2 LMJ.RY0402.195793 antisense 3'UTR 95
LMJ.RY0402.196538_1 LMJ.RY0402.196538 antisense intron 73
LMJ.RY0402.197337_1 LMJ.RY0402.197337 sense CDS 73
LMJ.RY0402.198600_2 LMJ.RY0402.198600 sense 3'UTR 73
LMJ.RY0402.198739_1 LMJ.RY0402.198739 sense CDS 73
LMJ.RY0402.199952_1 LMJ.RY0402.199952 antisense intron 73
LMJ.RY0402.201387_1 LMJ.RY0402.201387 sense CDS 73
LMJ.RY0402.203834_1 LMJ.RY0402.203834 sense intron 73
LMJ.RY0402.205905_1 LMJ.RY0402.205905 antisense intron 73
LMJ.RY0402.207680_1 LMJ.RY0402.207680 antisense intron 95
LMJ.RY0402.207680_2 LMJ.RY0402.207680 antisense intron 95
LMJ.RY0402.208031_1 LMJ.RY0402.208031 sense intron 95
LMJ.RY0402.208031_2 LMJ.RY0402.208031 sense intron 95
LMJ.RY0402.210834_1 LMJ.RY0402.210834 antisense intron 73
LMJ.RY0402.211133_1 LMJ.RY0402.211133 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.211449_4 LMJ.RY0402.211449 sense CDS 95
LMJ.RY0402.211644_3 LMJ.RY0402.211644 antisense intron 73
LMJ.RY0402.212594_2 LMJ.RY0402.212594 antisense CDS 58
LMJ.RY0402.212950_3 LMJ.RY0402.212950 sense intron 73
LMJ.RY0402.213940_1 LMJ.RY0402.213940 sense intron 58
LMJ.RY0402.214191_1 LMJ.RY0402.214191 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.214254_1 LMJ.RY0402.214254 antisense intron 73
LMJ.RY0402.214341_2 LMJ.RY0402.214341 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.214512_1 LMJ.RY0402.214512 antisense intron 73
LMJ.RY0402.215380_1 LMJ.RY0402.215380 sense CDS 73
LMJ.RY0402.218504_1 LMJ.RY0402.218504 sense intron 95
LMJ.RY0402.218504_2 LMJ.RY0402.218504 sense intron 95
LMJ.RY0402.220593_1 LMJ.RY0402.220593 sense intron 73
LMJ.RY0402.220709_1 LMJ.RY0402.220709 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.222785_1 LMJ.RY0402.222785 antisense CDS 58
LMJ.RY0402.224260_1 LMJ.RY0402.224260 antisense intron 58
LMJ.RY0402.225562_1 LMJ.RY0402.225562 sense CDS 95
LMJ.RY0402.225562_2 LMJ.RY0402.225562 sense CDS 95
LMJ.RY0402.225620_1 LMJ.RY0402.225620 sense intron 58
LMJ.RY0402.226935_1 LMJ.RY0402.226935 sense CDS 95
LMJ.RY0402.226935_2 LMJ.RY0402.226935 sense CDS 95
LMJ.RY0402.227425_1 LMJ.RY0402.227425 sense intron 73
LMJ.RY0402.227665_1 LMJ.RY0402.227665 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.227665_2 LMJ.RY0402.227665 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.227849_2 LMJ.RY0402.227849 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.227849_3 LMJ.RY0402.227849 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.229278_1 LMJ.RY0402.229278 sense intron 95
LMJ.RY0402.229278_2 LMJ.RY0402.229278 sense intron 95
LMJ.RY0402.230888_3 LMJ.RY0402.230888 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.235154_1 LMJ.RY0402.235154 sense CDS 73
LMJ.RY0402.236964_1 LMJ.RY0402.236964 sense intron 73
LMJ.RY0402.237903_1 LMJ.RY0402.237903 antisense CDS 58
LMJ.RY0402.237909_1 LMJ.RY0402.237909 sense CDS 73
LMJ.RY0402.239394_1 LMJ.RY0402.239394 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.240270_1 LMJ.RY0402.240270 antisense intron 73
LMJ.RY0402.240956_1 LMJ.RY0402.240956 antisense CDS 95
LMJ.RY0402.240956_2 LMJ.RY0402.240956 sense CDS 95
LMJ.RY0402.241054_1 LMJ.RY0402.241054 sense CDS 73
LMJ.RY0402.241224_1 LMJ.RY0402.241224 antisense CDS 73
LMJ.RY0402.241254_1 LMJ.RY0402.241254 sense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.241254_2 LMJ.RY0402.241254 sense 5'UTR 95
LMJ.RY0402.245011_2 LMJ.RY0402.245011 antisense intron 58
LMJ.RY0402.246418_1 LMJ.RY0402.246418 sense intron 73
LMJ.RY0402.254601_1 LMJ.RY0402.254601 antisense 5'UTR 73
LMJ.RY0402.254610_1 LMJ.RY0402.254610 sense 3'UTR 95
LMJ.RY0402.254610_2 LMJ.RY0402.254610 sense 3'UTR 95
LMJ.RY0402.254774_1 LMJ.RY0402.254774 sense CDS 95
LMJ.RY0402.254774_2 LMJ.RY0402.254774 sense CDS 95
LMJ.RY0402.256089_1 LMJ.RY0402.256089 sense intron 95
LMJ.RY0402.256089_2 LMJ.RY0402.256089 sense intron 95

Gene Annotations

PFAM:
PANTHER: PTHR13555 PTHR13555:SF2
KEGG_ec:
KEGG_orthology:
KOG:
Gene ontology terms::
Best arabidopsis TAIR name:
Best arabidopsis TAIR symbol:
Best arabidopsis TAIR defline:
Phytozome Locus Page

Phenotypes

Mutants in this gene exhibit a phenotype under the following conditions:

Photosynthesis or light sensitivity, screen 8 of 12 ( 77% confidence (FDR = 0.23))

Note: FDR indicates the likelihood that a particular genotype-phenotype relationship is incorrect. Not all mutants in a particular gene show the same phenotype. Please see the mutant pages for each mutant's phenotypes. Complementation is needed to definitively prove a genotype-phenotype link. These data are from a pooled phenotyping experiment.

If you reference the phenotypic data above in a manuscript, please cite: Fauser et al. 2022 Nature Genetics.